Povinná nejsou žádná očkování. Doporučujeme zkontrolovat, případně doplnit klasická očkování proti záškrtu, tetanu a dětské obrně. Zvážit byste měli očkování proti žloutence typu A i B a břišnímu tyfu. Pakliže se chystáte i mimo hlavní města, je vhodné také očkování proti žluté zimnici. V Amazonii je možnost výskytu malárie, vhodná jsou proto antimalarika.
Zdravotní rizika jsou zvýšená především v odlehlých oblastech a v oblasti Amazonie. Setkat se zde můžete se žlutou zimnicí, malárií či horečkou dengue. Proti žluté zimnici a malárii se můžete dopředu nechat naočkovat. Proti horečce dengue, kterou přenášejí nakažení komáři, neexistuje žádné očkování. Komáři mohou také přenášet virus zika, který ohrožuje především těhotné ženy, neboť může způsobovat vznik mikrocefalie nebo jiné těžké vývojové poruchy plodu. Nejlepší prevencí je používání repelentu a moskytiér. Před cestou si také vždy raději zjistěte aktuální situaci v dané lokalitě.
Voda z vodovodu je v Brazílii sice pitná, o její kvalitě se však příliš hovořit nedá. Doporučujeme vodu minimálně převařovat nebo sterilizovat. V odlehlejších oblastech raději volte vodu balenou.