Guinea-Bissau vyžaduje po turistech jediné povinné očkování, a tím je očkování proti žluté zimnici, jež musíte mít uvedené v očkovacím průkazu. Vzhledem k tomu, že tato africká země se potýká spíše s horšími hygienickými podmínkami, je dobré využít i doporučených typů očkování. Mezi ně spadá například žloutenka typu A, žloutenka typu B, břišní tyfus, meningitida a tetanus.
Jak už bylo zmíněno v kapitole výše, Guinea-Bissau bojuje s hygienickými návyky, takže v tomto směru se můžete potkat s jediným nebezpečným onemocněním. A tím je cholera. Před cestou do země tak konzultujte i očkování proti této nemoci, a to v závislosti na tom, do jakých oblastí se chystáte.
Počítejte také s tím, že období od června do listopadu je spjato se zvýšeným výskytem malárie. Tu pochopitelně přenáší komáři. Vyzbrojte se proto dostatečnou zásobou účinných repelentů a pokud to bude možné, využívejte také moskytiéry při spaní. Vzít si se sebou můžete antimalarika.
V žádném případě nekonzumujte kohoutkovou vodu, která je závadná a může vám způsobit nepříjemné žaludeční komplikace, včetně horších střevních onemocnění. Využívejte pouze balenou vodu. Ta je dostupná na všech místech. S pomocí ní si také omývejte konzumované ovoce a zeleninu. V lepším případě takové plody raději zbavte slupky, čímž zamezíte přenosu jakýchkoliv nežádoucích nákaz. Pro jistotu se vyhýbejte pouličním stánkům s jídlem a jezte pouze tam, kde budete mít záruku náležité tepelné úpravy pokrmu.