Malta po svých návštěvnících nevyžaduje žádné povinné očkování. Jedinou výjimkou může být pouze to, kdybyste na ostrov přicestovali ze země s výskytem žluté zimnice, pak je pravděpodobné, že by po vás mohli úředníci vyžadovat mezinárodní očkovací průkaz. Jako doporučené očkování je mnohdy uváděná žloutenka typu A, žloutenka typu B, břišní tyfus a tetanus. Je však pravdou, že kvalita hygieny je na ostrově na vysoké úrovni a nic podobného většina cestovatelů stejně neřeší.
Na Maltě se nemusíte obávat jakýchkoliv zdravotních rizik. V zemi se nevyskytují žádné exotické nemoci, a dokonce na ní nežijí ani nebezpečná a jedovatá zvířata. Počítat můžete naopak s vyšší úrovní lékařského zázemí. Takže stačí, když nepodceníte své cestovní pojištění.
Kohoutková voda na Maltě je pitná. Je však pravdou, že vzniká odsolováním a někomu jednoduše nemusí chutnat. Je to způsobeno tím, že Malta má pomalu jedny z nejmenších zásob sladké vody na světě. Proto se spousta turistů spoléhá spíše na balenou vodu, ale v tomto případě je to pouze vaše volba. Z vody ve vodovodním řádu byste neměli dostat žádné střevní onemocnění.