Plošně pro všechny cestovatele není žádné očkování povinné. Pokud byste ale do Rwandy přijížděli ze země, kde je zde se vyskytuje žlutá zimnice, musíte se nechat očkovat. Další očkování jsou spíše doporučená. Očkování proti žloutence typu A a B a břišnímu tyfu se do této oblasti doporučuje běžně.
Ve Rwandě vás může komár nakazit malárií. Nejlépe se proti ní chráníte, pokud používáte repelent a jste běžně ostražití. Pokud byste spali venku, je třeba spát v moskytiérách. Jestli se budete pohybovat v rizikovějších oblastech jako například kolem vody, můžete se před cestou poradit s cestovním lékařem, jestli nemáte preventivně užívat antimalarika. Před odjezdem nepodceňte cestovní pojištění, abyste neměli zbytečné problémy se zdravotní péčí.
Voda z vodovodu pro nás ve Rwandě není pitná. Můžete pít vodu balenou v neporušených obalech, nebo si vodu z vodovodu převařit či filtrovat.