Zanzibar je spojen pouze s jedním povinným očkováním, a to díky tomu, že spadá pod Tanzanii, kde tento předpis platí. Je to očkování proti žluté zimnici, jež byste museli předkládat hlavně tehdy, když vaše mezipřistání bude přes některou z východních zemí Afriky. V opačném případě se s tímto požadavkem nemusíte setkat. Při cestě na Zanzibar platí i další, avšak už jen doporučená očkování, mezi která patří žloutenka typu A a B, tetanus, cholera a břišní tyfus.
Větší zdravotní riziko představuje stojatá voda, v rámci níž se projevuje onemocnění zvané schistosomóza. Tato nemoc postihuje především močové cesty, játra a zažívací ústrojí. Pokud se budete chtít osvěžit a vykoupat, dejte raději přednost slané vodě.
Připravte si i dostatečnou zásobu repelentů proti létajícím komárům, jež mohou být přenašeči různých nemocí. Výjimečně se setkáte s horečkou dengue a malárií. Je to však jen ve vyhraných oblastech.
Voda z kohoutku na Zanzibaru není rozhodně pitná. Takže pro všechny možné úkony, jakými jsou pití, vyplachování úst při čištění zubů nebo omývání zeleniny a ovoce využívejte pouze balenou vodu. Ta je dostupná všude.