Podnebí Mikronésie je typicky tropické a vlhké. Celoroční průměrné teploty dosahují 28 °C. Díky tomu je možné navštívit ostrovy kdykoliv během celého roku. Menší období dešťů, kdy padne nejvíce srážek, trvá zhruba od července do listopadu. Na ostrovech blíže k rovníku však prší téměř po celý rok. Nejlepší doba pro návštěvu Mikronésie je zimní období listopad-duben, kdy jsou teploty stále příjemné a je zde relativně nízká vlhkost s minimem srážek.